1、急性炎症反应：如未能准确测量根管的工作长度、根管预备方法不正确、根管清理不彻底、填充时机把握不当等因素，会导致急性炎症反应，出现自发痛、局部肿胀、咬合痛等症状。此时，可酌情予以消炎、止痛、切开引流治疗。

2、器械折于根管内：如根管预备中遇到阻力仍强行进入，用力过大，超过了器械所能承受的程度；器械材料质量欠佳；未按操作要求使用器械（跳号），器械在细窄根管内被卡住后，仍勉强旋转器械柄等因素，会导致器械折于根管内。一旦发生，要尽量取出，可拍X线片，检查器械折断情况。

3、髓腔穿孔：如术者不熟悉髓腔解剖形态、变异、增龄性变化及穿孔的好发部位；术者操作不规范，根管机械预备时，未按由小到大的顺序使用根管器械（跳号），未掌握好开髓和根管预备的方法；术者思想不重视，麻痹大意，责任心不强等因素，会导致髓腔穿孔，表现为器械插入穿通处，引起牙周组织出血，有探痛。穿通发生后，应立即修复，再行根管治疗。

4、牙折：经根管治疗后的牙齿，因失去了牙髓的营养使脆性增大易折裂；制备开髓洞形时，过多的磨除了牙体组织，削弱了牙体组织强度，抗力形较差；根管清理、成形以及做冠桩预备过程中，过多的去除根管侧壁；根管充填时，侧向或垂直压力过大，均可造成牙根纵折；未降低咬合，牙尖过陡，或咀嚼过硬食物，均易发生牙折。一旦发生应积极治疗，尽可能保存患牙。

5、其他：可能还会出现器械落入消化道或呼吸道、皮下气肿等并发症，一旦出现需立即进行相应的处理措施。