1、按分子组成结构分类
(1)单体酶:由一条多肽链组成的酶,如牛胰核糖核酸酶 A、溶菌酶、羧肽酶 A 等。
(2)寡聚酶:由多个相同或不同的亚基以非共价键连接组成的酶。例如,蛋白质激酶A、磷酸果糖激酶。
(3)多酶复合物(多酶体系):几种具有不同催化功能的酶可彼此聚合形成的复合物,其催化底物反应的过程如同流水线,上一个酶的产物即成为下一个酶的底物,形成连锁反应。
(4)多功能酶(串联酶):在一条肽链上同时具有多种不同的催化功能及/或结合功能的酶。例如,氨基甲酰磷酸合成酶II、天冬氨酸氨基甲酰转移酶和二氢乳清酸酶。
2、根据酶催化的反应类型分类
(1)氧化还原酶类:催化氧化还原反应的酶属于氧化还原酶类,包括催化传递电子、氢以及需氧参加反应的酶。例如乳酸脱氢酶、琥珀酸脱氢酶、细胞色素氧化酶、过氧化氢酶、过氧化物酶等。
(2)转移酶类:催化底物之间基团转移或交换的酶属于转移酶类。例如甲基转移酶、氨基转移酶、乙酰转移酶、转硫酶、激酶和多聚酶等。
(3)水解酶类:催化底物发生水解反应的酶属于水解酶类。按其所水解的底物不同可分为蛋白酶、核酸酶、脂肪酶和脲酶等。根据蛋白酶对底物蛋白的作用部位,可进一步分为内肽酶和外肽酶。同样,核酸酶也可分为外切核酸酶和内切核酸酶。
(4)裂合酶类:催化从底物移去一个基团并形成双键的反应或其逆反应的酶属于裂合酶类。例如脱水酶、脱羧酶、醛缩酶、水化酶等。
(5)异构酶类:催化分子内部基团的位置互变,几何或光学异构体互变,以及醛酮互变的酶属于异构酶类。例如变位酶、表异构酶、异构酶、消旋酶等。
(6)连接酶类:催化两种底物形成一种产物并同时偶联有高能键水解和释能的酶属于连接酶类。此类酶催化分子间的缩合反应,或同一分子两个末端的连接反应;在催化反应时需核苷三磷酸(NTP)水解释能。例如DNA连接酶、氨酰tRNA合成酶、谷氨酰胺合成酶等。
(7)易位酶类:将离子或分子从膜的一面易位到另一面的酶属于易位酶类,又称“转位酶”,是2018年新增加的一类。例如ABC型硫酸转运体、线粒体蛋白质转运ATP酶等。