元气,是人体最根本、最重要的气,是人体生命活动的原动力。元气,《难经》又称“原气”；《内经》虽无“元气”或“原气”之称,但有“真气”之说。元气、原气、真气,三者的内涵是同一的,都是指先天之气。
所谓“命门”,最早见于《内经》,系指眼睛而言。《难经》中则最早将命门作为内脏提出,认为右肾为命门。明清以来,对命门开展了较为深入的研究,才出现了各种不同见解,命门的重要性也引起了广泛重视。
命门系元气,为元气之根。此理论源于《难经》,《难经·三十六难》：“命门者,诸神精之所舍,原气之所系也；男子以藏精,女子以系胞。故知肾有一也”,此原气通元气。《难经》借以和推出了“命门”的概念,强调元气的重要作用,命门为元气发生之处。命门是人体三宝——精、气、神之根柢,是主宰人体基本生命单位；三宝之中以元气为主导,精化生气,气能摄精,气足神旺,而维系元气的化生正是命门的主要功能。关于命门的部位,《三十六难》曰：“肾两者,非皆肾也,其左者为肾,右者为命门。”《难经》这种“左肾右命门”的描述,从解剖角度似有不妥,但根据《难经》时代特点分析,其“左右”之义,更多指代水火阴阳,言“右肾”、或“动气”是强调命门元气对人体的温煦和动力作用。然而,《三十九难》又曰：“命门者……其气与肾通”,命门之“藏精”、“系胞”、“诸神精之所舍”与“肾藏精与志”（《三十四难》）基本是一致的。因此,可以认为命门为肾间发生元气的功能单位。
《景岳全书·传忠录·命门余义》：“然命门为元气之根,为水火之宅。五脏之阴气非此不能滋,五脏之阳气非此不能发。”则表明命门所藏的元阴、元阳为人体阴精、阳气的根源。
